Identyfikacja markerów otyłości psów przy pomocy sekwencjonowania całogenomowego

Projekt badawczy finansowany przez Narodowe Centrum Nauki

Opis badań

Pies (Canis lupus familiaris) jest ważym gatunkiem towarzyszącym oraz modelem zwierzęcym w badaniach biomedycznych. Narastającym problemem zdrowotnym psów jest otyłość. Ponieważ otyłość skraca życie psa i powiązana jest z licznymi chorobami, dążymy do poznania jej przyczyn w celu profilaktyki i leczenia. Skłonność do otyłości jest uwarunkowana mutacjami wielu genów ale większość z nich pozostaje nieznana. W genomach ssaków można spotkać liczne duplikacje albo braki dłuższych fragmentów (tzw. CNV). Naszym głównym celem jest poznanie tych CNV, które zwiększają ryzyko otyłości psów. Dodatkowym celem jest poszerzenie opisu genomu psa, skupiając się właśnie na CNV. Badamy całogenomowe sekwencje DNA psów otyłych i z prawidłową masą ciała aby stwierdzić, czy istnieją pewne CNV, które można spotkać tylko w grupie psów chorych. Jednocześnie, opisujemy wszelkie znalezione CNV i porównujemy je do CNV występujących w genomie człowieka.

Znaczenie badań

Nasze badania mogą mieć wkład w poznanie przyczyn akumulacji tkanki tłuszczowej, w tym otyłości ludzi, która stała się chorobą cywilizacyjną. Człowiek i pies przebywają we wspólnym środowisku, czasami do pełnej starości. Geny odpowiedzialne za taką, a nie inną reakcję organizmu na zmieniające się środowisko, mogą być wspólne u człowieka i psa. Ponadto, niektóre ważne dla otyłości geny wystąpują rzadko u ludzi, ale często u psów. Takie geny umykają wykryciu, gdy badamy otyłość u ludzi, ale dają się wykryć, gdy badamy otyłe psy.

Schemat badań

Twój udział

Wciąż zbieramy dane do naszych badań. Psy rasy labrador, zarówno otyłe jak i zdrowe, są ważone oraz oceniane pod względem zaawansowania otyłości. Jednocześnie pobierane są próby do badań genetycznych. Jeżeli chcesz wziąć udział w badaniu, skontaktuj się z kierownikiem projektu.

Publikacje

• Antkowiak M., Szydlowski M. (2023). Uncovering structural variants associated with body weight and obesity risk in labrador retrievers: a genome-wide study. Frontiers in genetics, 14, 1235821. https://doi.org/10.3389/fgene.2023.1235821
• Sypniewski M., Szydlowski M. (2023). A Study of 41 Canine Orthologues of Human Genes Involved in Monogenic Obesity Reveals Marker in the ADCY3 for Body Weight in Labrador Retrievers. Veterinary sciences, 10(6), 390. https://doi.org/10.3390/vetsci10060390
• Szydlowski M. (2023). A clue to the etiology of disorders of sex development from identity-by-descent analysis in dogs with cryptic relatedness. Anim Genet. 2023;54(2):166-176. doi:10.1111/age.13276
• Szydlowski M, Antkowiak M. (2022). No evidence that long runs of homozygosity tend to harbor risk variants for polygenic obesity in Labrador retriever dogs. J Appl Genet. 2022;63(3):557-561. doi:10.1007/s13353-022-00693-0
• Antkowiak M., Nowacka-Woszuk J., Szczerbal I., Switonski M., Szydlowski M. (2020). AMY2B gene copy-number variation studied by Droplet Digital PCR (ddPCR) in three canids: Red Fox, Arctic Fox, and Chinese Raccoon Dog. Folia Biologica (Kraków), 68, no 2, https://doi.org/10.3409/fb_68-2.07
• Antkowiak M, Szczerbal I, Nowacka-Woszuk J, Switonski M, Szydlowski M. (2019). No association between AMY2B gene copy number and obesity risk in Labrador retriever dogs. Anim Genet. 2019;50(5):552-553. doi:10.1111/age.12824

Kierownik projektu
prof. Maciej Szydłowski
Katedra Genetyki i Podstaw Hodowli Zwierząt
Wołyńska 33, 60-637 Poznań
Email: maciej(@)up.poznan.pl
Telefon: +/48/61/8.487.147