Wybrane publikacje - Dr Alicja Szabelska-Beręsewicz

• Leśniewska A., Zyprych-Walczak J., Szabelska-Beręsewicz A., Okoniewski M. J. (2018). Genes sharing the protein family domain decrease the performance of classification with RNA-seq genomic signatures. Biology Direct, 13 (1), 3, doi: 10.1186/s13062-018-0205-x. [IF = 2.856]
• Anjanappa, R. B., Mehta, D., Okoniewski, M. J., Szabelska-Beręsewicz, A., Gruissem, W., Vanderschuren, H. (2017). Molecular insights into Cassava brown streak virus susceptibility and resistance by profiling of the early host response. Molecular Plant Pathology, doi: 10.1111/mpp.12565.[IF = 4.697]
• Różańska-Zawieja J., Szabelska-Beręsewicz A., Sobek Z., Nienartowicz-Zdrojewska A., Zyprych-Walczak J., Siatkowski I., (2017). Wpływ wielkości grup ojcowskich i stad na optymalną ocenę współczynnika odziedziczalności długości ciąży u bydła. Roczniki Naukowe Polskiego Towarzystwa Zootechnicznego, 13 (1), 9-17.
• Beręsewicz M., Alvarez A., Biecek P., Dyderski M. K., Kosiński M., Nowosad J., Rotter K., Szabelska-Beręsewicz A., Szymkowiak M., Wawrowski Ł., Zyprych-Walczak J. (2017). Conference Report: European R Users Meeting 2016. The R Journal, 9 (1), 501-504.
• Szabelska-Beręsewicz, A., Bilska A., Waszkowiak K., Siatkowski I., (2016). A note on the comparison of mixed-effects models for longitudinal studies. Biometrical Letters 53 (2), 165-173.
• Szenajch J., Góralski M., Świercz A., Szabelska A., Zyprych-Walczak J., Synowiec A., Siatkowski I., Handschuh L. (2016). Zmiany w ekspresji szlaków sygnałowych uczestniczące w wykształcaniu nabytej w obecności erytropoetyny oporności na ci-splatynę i paklitaksel w komórkach ludzkiego raka jajnika. Nowotwory, vol. 66, suppl. 2, p. 50.
• Wiewiorka M. S., Szabelska A., Okoniewski M. J., (2015). Analysis of AmpliSeq RNA-sequencing enrichment panels. In: Kryszkiewicz, M., Bandyopadhyay, S., Rybinski, H., Pal, S.K. (red.), Pattern Recognition and Machine Intelligence, 495-500. Warszawa: Springer International Publishing; doi: 10.1007/978-3-319-19941-2_47
• Zyprych-Walczak J., Szabelska A., Handschuh L., Gorczak K., Klamecka K., Figlerowicz M., Siatkowski I., (2015). The impact of normalization methods on RNA-seq data analysis. BioMed Research International, Article ID 621690; doi: 10.1155/2015/621690.[IF = 2.476]
• Gorczak K., Klamecka K., Szabelska A., Zyprych-Walczak J., Siatkowski I., (2014). Graphical methods for differential analysis of RNA-Seq data. Colloquium Biometricum 44, 167-181.
• Uszczynska B., Zyprych-Walczak J., Handschuh L., Szabelska A., Kazmierczak M., Woronowicz W., Kozlowski P., Sikorski M. M., Komarnicki M., Siatkowski I., Figlerowicz M., (2013). Analysis of boutique arrays: A universal method for the selection of the optimal data normalization procedure. International Journal of Molecular Medicine, 32 (3), 668-684. [IF = 1.957]
• Tomkowiak A., Weigt D., Broda Z., Mikolajczyk S., Szabelska A., Zyprych J., Siatkowski I., (2013). Analysis of relationship between genetic and phenotypic similarity of alfaalfa mutants inflorescences. Nauka Przyr. Technol. 7 (3) #34.
• Okoniewski M. J., Meienberg J., Patrignani A., Szabelska A., Matyas G., Schlapbach R., (2013). Precise breakingpoint localization of large genomic deletions using PacBio and Illumina next generation sequencers. Method summary. Biotechniques, 54 (2), 98-100. [IF = 2.669]
• Szabelska A., Zyprych-Walczak J., Siatkowski I., (2012). Application of linear mixed models in the selection of genes from microarray experiments with repeated measurements.  Colloquium Biometricum 42, 103-109.
• Okoniewski M. J., Lesniewska A., Szabelska A., Zyprych-Walczak J., Ryan M., Wachtel M., Morzy T., Schaeffer B., Schlapbach R., (2011). Preferred analysis methods for single genomic regions in RNA sequencing revealed by processing the shape of coverage. Nucleic Acids Research, doi: 10.1093/nar/gkr1249. [IF = 8.055]
• Schmidt M., L. Handschuh, Zyprych J., Szabelska A., Olejnik-Schmidt A., Siatkowski I., Figlerowicz M., (2011). Impact of DNA microarray data transformation on gene expression analysis - comparison of two normalization method. Acta Biochimica Polonica58 (4), 573-580. [IF = 1.234]
• Piekarska-Boniecka H., Siatkowski I., Szabelska A., (2011). The usefulness of similarity coefficients in the comparison of biocenosis structural units. Nauka Przyroda Technologia, 5 (6) # 111.
• Zyprych-Walczak J., Szabelska A., Siatkowski I., (2011). Application of statistical tests in gene selection problems. Biometrical Letters, 48 (2), 113-121.
• Waligora H., Weber A., Skrzypczak W., Szabelska A., (2011). Influence of weather conditions on damages of some types of sugar maize by frit fly (Oscinella frit L.). Nauka Przyroda Technologia 5 (2) #10.
• Siatkowski M., Szabelska A., Zyprych J., Weres J., Kujawa S., (2010). Growth curve functions in modeling the thin-layer drying of corn. Inżynieria Rolnicza 6 (124).
• Thornton A., Szabelska A., Zyprych J. et. al., (2010). Modelling and Optimization of Algae Growth. Proceedings of the 72nd European Study Group - Mathematics with Industry, 54-85.
• Siatkowski I., Goszczurna T., Szabelska A., Zyprych J., (2010). Coefficients of dissimilarity and similarity with applications. Colloquium Biometricum 40, p.13-23.
• Szabelska A., Siatkowski M., Goszczurna T., Zyprych J., (2010). Comparison of growth models in R. Nauka Przyroda Technologia 4 (4) #50.